Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDL3P58872 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms