Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OXCT1P55809 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OXCT1P55809 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OXCT1P55809 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms