Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAD23AP54725 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RAD23AP54725 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms