Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGA8P53708 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITGA8P53708 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITGA8P53708 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGA8P53708 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGA8P53708 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGA8P53708 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITGA8P53708 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms