Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TM4SF4P48230 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms