Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPRMP28827 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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