Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSFA2P28290 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSFA2P28290 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms