Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms