Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRCP23327 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRCP23327 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HRCP23327 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRCP23327 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms