Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCNA2P20248 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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