Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GM2AP17900 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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GM2AP17900 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GM2AP17900 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GM2AP17900 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GM2AP17900 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GM2AP17900 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GM2AP17900 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GM2AP17900 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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