Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XBP1P17861 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XBP1P17861 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
XBP1P17861 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XBP1P17861 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms