Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms