Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYP2C9P11712 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms