Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCDH8O95206 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDH8O95206 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDH8O95206 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PCDH8O95206 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PCDH8O95206 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCDH8O95206 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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