Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SMIM1B2RUZ4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms