Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms