Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms