Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PHF8Q9UPP1 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms