Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLIP2Q9UDT6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms