Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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