Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD1BQ9P298 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms