Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC180Q9P1Z9 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC180Q9P1Z9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms