Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ZMAT3Q9HA38 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms