Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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