Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SSBP4Q9BWG4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms