Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOXF2Q9BQY4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms