Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHP1Q99653 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms