Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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RNF185Q96GF1 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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