Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC107Q8WV48 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms