Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms