Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GIPC3Q8TF64 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.4 ms