Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ZIC4Q8N9L1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms