Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC117Q8IWD4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC117Q8IWD4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms