Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRRC28Q86X40 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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