Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPFIBP1Q86W92 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms