Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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CCDC80Q76M96 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC80Q76M96 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCDC80Q76M96 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CCDC80Q76M96 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CCDC80Q76M96 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CCDC80Q76M96 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCDC80Q76M96 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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