Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRIG3Q6UXM1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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