Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ANKRD40Q6AI12 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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