Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG16L1Q676U5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms