Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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