Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM71Q2Q1W2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM71Q2Q1W2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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