Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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