Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FAM187BQ17R55 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms