Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRNQ16849 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms