Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC23BQ15437 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms