Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAM2Q15035 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRAM2Q15035 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAM2Q15035 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAM2Q15035 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRAM2Q15035 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAM2Q15035 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAM2Q15035 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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