Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SMCO1Q147U7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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