Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTTNQ14247 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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