Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ALCAMQ13740 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ALCAMQ13740 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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